本校董事長周汝川博士鑒於台灣光復後牙醫師人才奇缺，遂於民國四十九年創設本校，當初牙科而已，以培養牙醫師為主旨且慕名國父 孫中山先之救國救民精神，故名為中山牙科專科學校，簡稱[中山牙專]。五十一年增設醫科為中山醫學專科學校，簡稱[中山醫專]，其後再增設護理科與醫事技術科。牙科﹑醫科﹑護理科招收高中畢業生，牙科修業初為四年後延長為五年，醫科修業先為四年後延長為五年乃至六年，護理科修業為三年均屬三專學歷，醫技科招收初中畢業生修業五年，屬於五專學歷。

　　早期本校校友，不論其先天秉賦後天之努力，與他人相較殊無遜色但因專科學歷之困擾進入社會服務與發展之機會，常受歧視無法與他人公平競爭，例如有些機構用人規定須繳七年成績單，本院校友無法提出因而被排除。故爭取改制以提昇學術水準與服務校友乃成為本院當務之急，經過長期奮鬥，始於民國六十六年獲准昇格為學院。

　　本校為邁向醫科大學而努力不懈，大力建設軟體與硬體設備已奠定良好之基礎。經教育部審核通過於90年8月1日起正式改名中山醫學大學，這是中山自創校四十年以來的另一個里程碑。目前本校包括醫學院、口腔醫學院、健康管理學院、醫學科技學院等四個學院及通識教育處，共有醫學相關科系十七個學系、八個研究所，其中四個有博士班。【醫學院】包含：醫學系、護理學系、心理學系（臨床組）、醫學研究所（碩、博班）、生物化學研究所（碩、博班）、毒理學研究所（碩、博班）、免疫學研究所（碩班）、護理學系碩士班；【口腔醫學院】包含：牙醫學系、口腔醫學研究所（碩班）、牙科材料研究所（碩班）；【醫學科技學院】包含：醫事技術學系、物理治療學系、職能治療學系、語言治療與聽力學系、生命科學系、醫學影像技術學系；【健康管理學院】包含：營養學系、營養科學研究所（碩、博班）、公共衛生學系、醫務管理學系、應用化學系、職業安全衛生學系、健康餐飲管理學系。另有，二年制護理學系、二年制檢驗技術學系、營養學系二年制在職進修專班、視光學系進修學士班及二年制醫務管理學系。

　　為迎合學術國際化之潮流，本校與國際知名學校如日本齒科大學、日本東京醫科大學、日本甲子園大學、菲律賓荷甘伯紀念醫院、美國哈佛大學、阿拉巴馬大學伯明罕醫學院、華西醫科大學、湖北醫科大學、等締結姊妹校學術交流，使本校學術活動，能夠躍上國際舞台與世界一流學府同步共舞。